View as: (view raw or row-normalized)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)
| Gene | Ovule (0-1 DPA) |
Ovule (2 & 5 DPA) |
Ovary |
Microspore |
Generative cell |
Pollen |
Sperm cell |
Pollen grain |
Pollen tube |
Pollen tube (1.5h) |
Pollen tube (3h) |
Pollen tube (9h) |
Pistil |
Style (before flowering) |
Style (after flowering) |
Style (pollinated, after flowering) |
Flower (buds) |
Flowers |
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA) |
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA) |
Pericarp/Exocarp (4 DPA) |
Pericarp |
Pericarp (5 DPA) |
Pericarp (7 DPA) |
Pericarp (10 DPA) |
Fruit (mature green) |
Fruit (breaker stage) |
Septum (7 DPA) |
Septum (10 DPA) |
Septum/Seed (4 DPA) |
Seed (5 DPA) |
Seed (7 DPA) |
Seed (10 DPA) |
Seeds (10 DPA) |
Seeds (20 DPA) |
Seeds (30 DPA) |
Seeds (Pk-stem) |
Seeds (Br-stem) |
Seeds (Pk-equatorial) |
Seeds (Pk-stylar) |
Seeds (Br-stylar) |
Seeds |
Seeds (RR) |
Seeds (LR) |
Seeds (MG-equatorial) |
Hypocotyl |
Seedling (leaves) |
Seedling (roots) |
Callus |
Meristem (vegetative) |
Meristem |
Apical meristem |
Leaf |
Root |
Root (differentiation zone) |
Root (elongation zone) |
Root (meristematic zone) |
Root hair cells |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Solyc00g500378.1.1 (Solyc00g500378) |
- | - | - | 2.28 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.06 | - | - | - | - | - | - | - | 2.31 | - | - | - | 1.42 | - | - | - | - | - | 5.27 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.51 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc00g500381.1.1 (Solyc00g500381) |
3.27 | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | 2.34 | - | - | - | 2.69 | - | - | - | - | - | - | 0.83 | - | - | - | - | - | - | - | 1.04 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.96 | - | - | - | -0.25 | - | - | - | - | - |
Solyc01g011480.1.1 (PSBC) |
- | - | - | - | - | - | 5.2 | - | 1.52 | - | - | - | - | 1.56 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.35 | - | - | - | - | - | - | 3.68 | - | - | - | 0.26 | - | - | - | - | - |
Solyc01g014710.1.1 (Solyc01g014710) |
- | - | - | - | - | - | 4.97 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.51 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.87 | - | - | - | -0.34 | - | - | - | - | - |
Solyc01g016580.1.1 (Solyc01g016580) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.85 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.76 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -2.14 | - | - | - | - | - |
Solyc01g065650.1.1 (Solyc01g065650) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.86 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc02g014400.1.1 (Solyc02g014400) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.86 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc02g020970.1.1 (Solyc02g020970) |
- | - | - | - | 2.56 | - | 1.98 | 0.92 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.09 | - | - | - | - | - | - | - | 1.36 | - | - | - | - | 2.69 | 4.64 | 3.0 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | 0.89 | - | - | - | -2.24 | - | - | - | - | - |
Solyc02g031700.3.1 (Solyc02g031700) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.78 | - | 2.59 | - | 0.07 | 0.15 | - | - | - | - | - | - | 2.78 | - | 0.58 | 5.15 | - | - | - | - | - | 1.4 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc02g031760.2.1 (Solyc02g031760) |
1.99 | 1.1 | 2.07 | 3.48 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.6 | -0.94 | - | - | - | -0.63 | 2.17 | - | - | - | - | - | 1.83 | - | - | - | 0.72 | - | 0.27 | -0.0 | - | - | - | 1.7 | 2.65 | - | - | - | - | - | - | - | 2.73 | - | - | - | 2.0 | - | - | - | -2.17 | - | - | - | - | - |
Solyc02g064880.1.1 (MAPKKK21) |
- | - | - | 2.56 | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.63 | - | - | - | - | 1.04 | 3.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.79 | - | 2.4 | - | -2.43 | - | - | - | - | - |
Solyc02g080700.3.1 (sks4) |
- | - | 1.86 | - | - | - | - | 3.06 | 2.4 | - | - | 0.5 | 1.36 | 0.8 | - | 0.43 | 2.23 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.5 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.51 | - | - | - | -0.11 | - | - | 3.47 | - | - |
Solyc03g071820.2.1 (IDN1) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.83 | - | 2.27 | - | 2.68 | - | - | - | - | 3.82 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.63 | 3.69 | - | - | -2.09 | - | - | - | - | - |
Solyc03g093617.1.1 (Solyc03g093617) |
- | - | - | 2.45 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.45 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.33 | - | - | - | - | - | 4.42 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc04g039790.3.1 (NDHB.1) |
- | - | - | 3.28 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.45 | - | 3.77 | - | - | 1.69 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.78 | - | - | - | - | - | - | 4.17 | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - |
Solyc04g049075.1.1 (CRK8) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.98 | - | - | - | - | - | - | 3.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc04g050080.1.1 (MYB70) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.86 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc04g064450.1.1 (Solyc04g064450) |
- | - | - | - | 3.34 | - | - | -2.64 | - | - | - | - | - | -0.94 | - | -1.14 | - | - | - | - | 2.59 | - | - | -1.08 | 1.79 | - | - | 2.26 | 2.85 | 0.82 | - | 0.44 | 2.79 | - | 3.27 | - | - | - | - | - | - | -1.87 | - | - | - | - | - | - | 2.26 | - | - | - | -3.96 | - | - | - | - | - |
Solyc05g014570.1.1 (Solyc05g014570) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.39 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.04 | - | - | - | 3.87 | 5.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.52 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc05g014870.3.1 (HTA2) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.65 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.04 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc05g018440.1.1 (Solyc05g018440) |
- | - | - | - | 2.77 | - | - | - | -0.91 | - | -0.98 | -1.46 | - | 1.15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -1.13 | - | - | - | - | - | - | - | -0.72 | 1.58 | - | - | 3.0 | - | 1.67 | 4.78 | - | - | 1.47 | - | - | - | - | - | -0.02 | 0.02 | - | - | - | -4.19 | - | - | - | - | - |
Solyc05g023755.1.1 (Solyc05g023755) |
2.39 | - | 1.12 | 2.56 | - | - | - | - | - | -0.37 | - | -0.32 | - | - | - | -0.64 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.12 | - | - | -1.37 | - | - | - | - | - | - | 2.74 | - | - | - | -0.69 | - | - | - | - | - |
Solyc05g041270.1.1 (CCOAMT) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.68 | - | - | 1.2 | 2.13 | - | - | 2.88 | 2.92 | 2.61 | - | 1.52 | 4.39 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc05g043440.1.1 (Solyc05g043440) |
2.58 | - | - | 2.23 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.86 | - | - | - | - | - | 5.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.05 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc05g045820.1.1 (RPS19) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.86 | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc05g050053.1.1 (Solyc05g050053) |
- | 1.23 | 1.72 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.64 | - | 2.51 | - | 3.85 | - | - | - | 3.89 | 0.54 | - | - | - | 1.64 | - | 0.09 | 2.46 | - | - | - | -0.86 | - | 1.4 | - | - | - |
Solyc05g050515.1.1 (Solyc05g050515) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | 0.07 | - | - | - | -0.64 | - | - | 2.1 | - | 0.75 | - | 0.62 | 1.77 | - | - | 1.07 | 1.27 | 2.13 | 1.44 | 3.33 | - | - | - | 2.93 | - | - | - | - | -0.19 | 3.16 | - | - | - | - | - | 2.32 | - | - | - | -2.17 | - | - | - | - | - |
Solyc05g050555.1.1 (Solyc05g050555) |
- | - | - | 2.14 | - | - | - | -2.2 | - | - | - | - | - | - | - | 0.1 | - | - | - | - | - | 3.33 | 2.29 | 1.59 | - | 3.56 | - | 0.29 | 1.7 | - | - | -0.27 | 1.49 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.0 | 1.91 | 1.4 | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc05g150118.1.1 (Solyc05g150118) |
- | - | - | - | - | - | - | -1.88 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.9 | 0.64 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.16 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.34 | - | - | - | - | - | 0.93 | - | - | 2.4 | -2.5 | - | - | - | - | - |
Solyc05g150126.1.1 (ORF240B) |
- | - | 1.87 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.09 | - | - | -0.0 | - | - | - | - | 2.24 | - | - | 1.23 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.46 | - | - | - | - | - | - | 2.2 | 1.95 | - | 2.36 | -2.52 | - | 3.8 | - | 3.23 | - |
Solyc06g051525.1.1 (Solyc06g051525) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.93 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.61 | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.4 | 5.1 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.91 | - | - | - | - |
Solyc07g015760.1.1 (Solyc07g015760) |
- | - | - | - | - | - | - | 1.81 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.77 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc07g019493.1.1 (CRK8) |
- | - | - | - | - | - | 3.01 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.69 | - | - | - | - | - | - | 4.36 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.86 | 3.69 | - | - | -1.58 | - | - | - | - | - |
Solyc07g032680.1.1 (Solyc07g032680) |
- | - | 1.36 | 2.19 | 3.08 | - | - | - | -0.53 | -1.78 | - | -1.96 | - | 1.22 | 1.66 | 1.95 | - | - | - | 2.48 | - | - | - | 1.39 | 2.91 | - | - | 2.61 | - | - | 1.64 | 2.79 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc08g016350.1.1 (Solyc08g016350) |
- | - | - | 4.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.73 | - | - | - | - | - | - | 2.11 | - | 2.26 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.64 | - | - | - | - | - | 1.89 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc08g060900.3.1 (Solyc08g060900) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.43 | - | - | - | 3.66 | - | - | - | - | - | 4.8 | 2.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc08g062030.1.1 (Solyc08g062030) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.3 | - | - | - | - | - | 3.56 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc08g062655.1.1 (Solyc08g062655) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.0 | - | 1.64 | - | - | - | - | 3.19 | - | - | - | 1.26 | 4.52 | - | - | - | - | - | 3.36 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc10g008267.1.1 (Solyc10g008267) |
-1.26 | - | -15.02 | 0.39 | 1.51 | 2.03 | -8.26 | 0.85 | 0.51 | - | - | - | -18.06 | 1.79 | - | -0.32 | -0.39 | -2.32 | - | - | - | - | -14.16 | -2.25 | 0.97 | - | - | -0.05 | -0.73 | -9.76 | -23.85 | 1.58 | 2.22 | - | 1.96 | 0.92 | - | 1.84 | - | - | - | -0.13 | 2.52 | - | 3.76 | - | - | - | -25.45 | - | -11.27 | - | -12.35 | - | - | - | - | - |
Solyc10g018710.1.1 (TCP4) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.51 | - | - | - | - | 4.18 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.83 | - | - | - | - | - | - | 4.49 | - | - | - | -1.72 | - | - | - | - | - |
Solyc10g038040.1.1 (Solyc10g038040) |
2.14 | - | 3.1 | 2.9 | 2.95 | - | - | - | - | - | - | - | 2.38 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.0 | - | - | - | 0.93 | - | 2.76 | - | - | - |
Solyc10g049335.1.1 (Solyc10g049335) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.22 | 4.19 | - | - | 2.05 | 4.18 | - | 3.03 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc10g055130.2.1 (Solyc10g055130) |
- | - | - | - | - | 1.56 | - | -1.26 | 1.36 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.03 | - | - | 1.64 | - | 1.31 | - | 1.88 | - | - | - | 1.78 | - | 2.72 | 1.86 | 0.27 | - | - | - | - | - | - | 3.36 | - | - | - | - | - | - | - | 2.8 | 1.29 | - | - | - | -2.83 | - | - | - | - | - |
Solyc11g032025.1.1 (CRK8) |
- | - | - | 3.6 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.01 | - | 2.54 | - | - | - | - | - | - | 2.03 | - | 3.73 | -5.41 | - | - | - | - | - | 1.39 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.85 | - | - | - | -1.3 | - | - | - | - | - |
Solyc11g042770.1.1 (Solyc11g042770) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.43 | 1.5 | - | 4.47 | - | - | - | - | 2.97 | - | -0.01 | 4.34 | - | - | - | - | - | 1.59 | - | - | - | -2.12 | - | - | - | - | - |
Solyc11g045332.1.1 (SNL2) |
- | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -0.36 | - | - | - | - | 1.2 | - | - | 0.31 | -0.31 | 0.5 | - | 1.74 | 2.05 | 1.98 | 1.93 | 2.04 | 3.15 | - | 2.78 | 3.07 | - | 0.13 | - | - | - | -1.01 | 1.22 | - | 0.93 | - | - | - | -1.67 | - | - | - | -4.12 | - | - | -0.49 | - | - |
Solyc11g050900.2.1 (Solyc11g050900) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.93 | - | - | -0.26 | 1.83 | - | - | 1.07 | 3.71 | 3.31 | - | 2.23 | 3.32 | - | 3.05 | 0.48 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -1.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Solyc11g062040.1.1 (YCF2.1) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | -17.33 | - | 3.07 | 5.32 | - | - | - | - | - | - | 3.29 | - |
Solyc12g010770.1.1 (Solyc12g010770) |
- | - | - | 3.24 | 4.13 | - | 4.56 | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.46 | - | - | - | -0.5 | - | - | - | - | - |
Solyc12g040750.1.1 (Solyc12g040750) |
- | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.72 | - | - | 0.37 | - | - | - | - | - | - | 1.97 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.
